La organización del PAEA está a cargo de la Coordinación de Innovación que, a través del Proyecto de Innovación Docente, realiza las gestiones académicas y administrativas pertinentes para la implementación del Programa durante el trimestre de invierno.
Los cursos del PAEA son en modalidad mixta y el diseño instruccional está a cargo del profesorado especialista en cada una de las UEAs mencionadas anteriormente.
La distribución de contenidos y actividades que acompañan a cada uno de los cursos la determinan los profesores de cada UEA que participa en el PAEA, tomando en cuenta las necesidades de aprendizaje del alumnado que se inscribe. Los ejercicios y actividades de los cursos que conforman el PAEA están diseñados y seleccionados para que el alumnado comprenda la información más significativa y esencial de cada una de las UEA, así como para reforzar los temas que ya han sido vistos con anterioridad.
El objetivo es que este cúmulo de acciones permitan a las y los estudiantes obtener una evaluación aprobatoria conservando los créditos del programa en el cual se encuentran inscritos.
